Por: Microsoft for Startups.

Una iniciativa innovadora promete revolucionar nuestra comprensión de la biodiversidad y sus aplicaciones, y está impulsada por Microsoft y NVIDIA. Presentamos Basecamp Research.

El equipo de investigación de Basecamp tiene la misión de digitalizar la naturaleza, a través de transformar el material biológico en datos para descubrir los secretos del mundo natural. Este ambicioso proyecto tiene como objetivo cerrar la brecha entre la biotecnología y la biodiversidad, para crear la base de datos de secuencias de proteínas biológicas más grande y de más rápido crecimiento del mundo, que contiene más de 9.800 millones de nuevas secuencias y más de un millón de especies recién descubiertas, lo que amplía el árbol de la vida conocido en más de diez veces en comparación con todas las bases de datos públicas combinadas.

Esta escala no es solo un hito científico, es un avance que permite a los investigadores modelar la evolución misma, para brindar una ventana a cómo la vida en la Tierra se ha adaptado y diversificado durante miles de millones de años.

Cuando miras una cucharada de tierra, podría haber tantos seres vivos en esa cucharada de tierra como humanos en el planeta.

—Marlon Clark, líder de colaboración e innovación, Basecamp Research

Basecamp Research no solo construye una lista más larga de especies catalogadas, sino que crea una base de datos de una escala y complejidad diferentes por completo. Este conjunto de datos integral permite que los modelos avanzados de IA descubran las reglas y mecanismos de la evolución, identifiquen nuevas proteínas y vías y diseñen nuevas soluciones biológicas para los desafíos de la medicina, la sostenibilidad y más.

La evolución es la fuerza más poderosa de la biología, y al comprender cómo la naturaleza la usa para resolver problemas, no podemos subestimar el impacto que esto tendrá en los avances de la biología.

—John Finn, director científico, Basecamp Research

Como parte del  programa Microsoft for Startups y NVIDIA Inception, Basecamp Research tiene las herramientas y los recursos necesarios para descubrir los secretos de la biodiversidad e impulsar la innovación en biotecnología. Al combinar la base de nube escalable de Azure con la innovación de IA de pila completa de NVIDIA, Basecamp Research allana el camino para una nueva era de descubrimiento biológico e inspira a otros a explorar el increíble potencial de la naturaleza. Microsoft y NVIDIA impulsan los modelos de IA de Basecamp Research para procesar y analizar datos a mayores velocidades, lo que acelera aún más su investigación y les permite abordar desafíos biológicos complejos.

El enfoque de la startup es convertir material biológico en datos a través de la secuenciación del ADN, un proceso que revela los intrincados detalles de los organismos que habitan nuestro planeta. Estos datos se utilizan para construir una base de datos completa de más de 10 mil millones de secuencias de proteínas novedosas que no solo catalogan la diversidad de la vida, sino que también entrenan una nueva familia de modelos de base, para aprovechar los conocimientos sobre cómo funcionan estos organismos e interactúan con su entorno, lo que sienta las bases para inspirar nuevas innovaciones en biotecnología.

No solo usamos nuestra base de datos para comenzar a identificar nuevas proteínas que podamos usar. También usamos los modelos de IA que construimos para ayudarnos a comenzar a evolucionar esas proteínas para que tengan las características que queremos sin hacer millones de variantes.

—John Finn, director científico, Basecamp Research

Microsoft y NVIDIA: Impulsar el próximo salto en el descubrimiento biológico

La misión de Basecamp Research está impulsada por una combinación única de Microsoft Azure y la plataforma de IA NVIDIA de pila completa. Juntas, estas tecnologías proporcionan la infraestructura escalable, las herramientas avanzadas de IA y la computación acelerada necesarias para procesar y analizar el conjunto de datos biológicos más grande y diverso del mundo.  

Al aprovechar la potencia de los servicios en la nube de Azure, Basecamp Research puede procesar y analizar grandes cantidades de datos biológicos de manera eficiente y eficaz. La escalabilidad y flexibilidad de Azure permiten al equipo controlar los conjuntos de datos masivos generados a partir de la secuenciación de ADN y otros análisis biológicos.

Una de las ventajas clave de Azure es su capacidad para admitir cargas de trabajo de informática de alto rendimiento (HPC, por sus siglas en inglés) aceleradas por NVIDIA. Esto es crucial para Basecamp Research, ya que su trabajo implica tareas computacionales complejas que requieren una potencia de procesamiento significativa. Las funcionalidades de HPC de Azure permiten al equipo ejecutar simulaciones y análisis a gran escala, acelerando sus procesos de investigación y detección.

Además, las herramientas de inteligencia artificial y aprendizaje automático de Azure y NVIDIA son fundamentales para ayudar a Basecamp Research a obtener información significativa de sus datos. Al aprovechar Azure Machine Learning y el marco NVIDIA BioNeMo, el equipo puede crear, entrenar e implementar modelos de inteligencia artificial sofisticados que pueden predecir e identificar patrones en datos biológicos. Esto les permite descubrir nuevos conocimientos biológicos y desarrollar soluciones innovadoras inspiradas en la naturaleza.

Hacer que los aprendizajes sean accesibles

El equipo de investigación de Basecamp también se compromete a garantizar que los beneficios de su trabajo se compartan con las comunidades con las que colaboran. Mejoran la capacidad local mediante la construcción de laboratorios, el intercambio de datos y la capacitación de científicos, y devuelven los ingresos a estas comunidades cuando sus datos conducen al éxito comercial.

Desde el trabajo que realizan hasta la tecnología que eligen, el proyecto Basecamp Research es un testimonio del poder de la colaboración y la innovación. Al romper el «muro de datos» que ha limitado el progreso en las ciencias de la vida, la base de datos de Basecamp potencia la biología generativa, a través de la utilización de la IA para diseñar, generar y anotar proteínas, vías y terapias con un nivel de precisión y creatividad que antes era imposible

En esencia, Basecamp Research como empresa se basa en esta idea de que la biología tiene las respuestas y el proceso de evolución ha llevado a este sistema complejo en verdad notable que no debería funcionar y, sin embargo, lo hace. De manera fundamental, dependemos mucho de la biodiversidad y poder estudiarla y comprenderla es una de las cosas más importantes que puedes hacer.

—Phoebe Oldach, vicepresidenta de crecimiento de datos, Basecamp Research

Para profundizar en este fascinante recorrido y presenciar el trabajo innovador del equipo de investigación de Basecamp, vean el video completo. Para otras aplicaciones intrigantes de la tecnología de Microsoft y NVIDIA, sigan la serie Catalyst.

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